一、药物治疗：对于较小较少的损害。
（1）5%5-fu软膏 5-fu是一种常用的抗肿瘤药物，它能抑制细胞的增殖，力量较为温和，一般需治疗2～3周。
（2）醋酸：三氯醋酸是一种强酸，可用来烧灼疣体，一般用于治疗ⅱ型病变。涂抹前先用棉球醮2%的卡因贴敷于病变局部3￣5分钟后，用棉签醮50%三氯醋酸涂抹病变，使药液达基底部；涂药时注意勿伤及周围健康粘膜组织，经期勿用；每周用药2次。或用20%柳酸冰醋酸外搽。
二、微波治疗：这是进入90年代后兴起的治疗方法。它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死脱落。微波治疗的特点是，疣体破坏！，不易复发，但创面恢复较慢，容易继发感染。所以微波治疗特别适用于治疗疣体较大的，孤立、散在的，同时要远离包皮系带的尖锐湿疣，以防损伤包皮系带，影响男性的性功能。
三、冷冻治疗：液氮或二氧化碳干冰冷冻，使疣组织（即皮肤损害局部）坏死。尖锐湿疣是由于尖锐湿疣病毒的感染，导致皮肤粘膜的良性增生。它有大量的小血管，增殖迅速。用冷冻的方法可使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水肿，从而破坏疣体。冷冻治疗的最大好处是局部不留痕迹，治愈率约70%左右。治疗过程中除局部红肿，疼痛及水疱反应外，一般无明显后遗症。可用喷雾法或直接接触法
